Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
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Glis3Q6XP49 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Glis3Q6XP49 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Glis3Q6XP49 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Glis3Q6XP49 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Glis3Q6XP49 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Glis3Q6XP49 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Glis3Q6XP49 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Glis3Q6XP49 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Glis3Q6XP49 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Glis3Q6XP49 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Glis3Q6XP49 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms