Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssx9Q6XAS3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssx9Q6XAS3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssx9Q6XAS3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssx9Q6XAS3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssx9Q6XAS3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssx9Q6XAS3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssx9Q6XAS3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssx9Q6XAS3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssx9Q6XAS3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssx9Q6XAS3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx9Q6XAS3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx9Q6XAS3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx9Q6XAS3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx9Q6XAS3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx9Q6XAS3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx9Q6XAS3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx9Q6XAS3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx9Q6XAS3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx9Q6XAS3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx9Q6XAS3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx9Q6XAS3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx9Q6XAS3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx9Q6XAS3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx9Q6XAS3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx9Q6XAS3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx9Q6XAS3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx9Q6XAS3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx9Q6XAS3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx9Q6XAS3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx9Q6XAS3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx9Q6XAS3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx9Q6XAS3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx9Q6XAS3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx9Q6XAS3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx9Q6XAS3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx9Q6XAS3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx9Q6XAS3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx9Q6XAS3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx9Q6XAS3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssx9Q6XAS3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssx9Q6XAS3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssx9Q6XAS3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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