Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms