Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms