Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcc2Q6PDG5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcc2Q6PDG5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcc2Q6PDG5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcc2Q6PDG5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcc2Q6PDG5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcc2Q6PDG5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcc2Q6PDG5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcc2Q6PDG5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcc2Q6PDG5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcc2Q6PDG5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc2Q6PDG5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc2Q6PDG5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc2Q6PDG5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc2Q6PDG5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc2Q6PDG5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc2Q6PDG5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc2Q6PDG5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc2Q6PDG5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc2Q6PDG5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc2Q6PDG5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc2Q6PDG5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc2Q6PDG5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc2Q6PDG5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc2Q6PDG5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc2Q6PDG5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc2Q6PDG5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc2Q6PDG5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc2Q6PDG5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc2Q6PDG5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc2Q6PDG5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc2Q6PDG5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc2Q6PDG5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc2Q6PDG5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smarcc2Q6PDG5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smarcc2Q6PDG5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smarcc2Q6PDG5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smarcc2Q6PDG5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smarcc2Q6PDG5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smarcc2Q6PDG5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smarcc2Q6PDG5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smarcc2Q6PDG5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smarcc2Q6PDG5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smarcc2Q6PDG5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smarcc2Q6PDG5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcc2Q6PDG5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms