Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms