Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trak1Q6PD31 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms