Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAI4

Lce3f, Late cornified envelope 3F, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lce3fQ6PAI4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms