Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2d40Q6P8N9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms