Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms