Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms