Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cpsf6Q6NVF9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms