Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms