Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ5

Sp140, Sp140 nuclear body protein, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp140Q6NSQ5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp140Q6NSQ5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp140Q6NSQ5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp140Q6NSQ5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp140Q6NSQ5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp140Q6NSQ5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp140Q6NSQ5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp140Q6NSQ5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp140Q6NSQ5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp140Q6NSQ5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp140Q6NSQ5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp140Q6NSQ5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sp140Q6NSQ5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp140Q6NSQ5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp140Q6NSQ5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp140Q6NSQ5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp140Q6NSQ5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp140Q6NSQ5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp140Q6NSQ5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp140Q6NSQ5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp140Q6NSQ5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp140Q6NSQ5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp140Q6NSQ5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp140Q6NSQ5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp140Q6NSQ5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp140Q6NSQ5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp140Q6NSQ5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp140Q6NSQ5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp140Q6NSQ5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp140Q6NSQ5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp140Q6NSQ5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp140Q6NSQ5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp140Q6NSQ5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp140Q6NSQ5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sp140Q6NSQ5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sp140Q6NSQ5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms