Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mvb12bQ6KAU4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms