Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms