Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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