Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smarca2Q6DIC0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms