Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFY8

Brinp2, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp2Q6DFY8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brinp2Q6DFY8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brinp2Q6DFY8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Brinp2Q6DFY8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Brinp2Q6DFY8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Brinp2Q6DFY8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Brinp2Q6DFY8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brinp2Q6DFY8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Brinp2Q6DFY8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brinp2Q6DFY8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Brinp2Q6DFY8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Brinp2Q6DFY8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brinp2Q6DFY8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brinp2Q6DFY8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brinp2Q6DFY8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brinp2Q6DFY8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brinp2Q6DFY8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brinp2Q6DFY8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brinp2Q6DFY8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Brinp2Q6DFY8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brinp2Q6DFY8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brinp2Q6DFY8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brinp2Q6DFY8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brinp2Q6DFY8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Brinp2Q6DFY8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms