Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdzrn3Q69ZS0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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