Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Sh3rf1Q69ZI1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Sh3rf1Q69ZI1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Sh3rf1Q69ZI1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3rf1Q69ZI1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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