Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg9aQ68FE2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg9aQ68FE2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg9aQ68FE2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg9aQ68FE2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg9aQ68FE2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg9aQ68FE2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg9aQ68FE2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg9aQ68FE2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg9aQ68FE2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg9aQ68FE2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg9aQ68FE2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg9aQ68FE2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg9aQ68FE2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg9aQ68FE2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg9aQ68FE2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg9aQ68FE2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg9aQ68FE2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg9aQ68FE2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg9aQ68FE2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms