Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp4eQ66X19 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrp4eQ66X19 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrp4eQ66X19 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrp4eQ66X19 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrp4eQ66X19 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrp4eQ66X19 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrp4eQ66X19 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrp4eQ66X19 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp4eQ66X19 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp4eQ66X19 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp4eQ66X19 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp4eQ66X19 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp4eQ66X19 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp4eQ66X19 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp4eQ66X19 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp4eQ66X19 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp4eQ66X19 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp4eQ66X19 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp4eQ66X19 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp4eQ66X19 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp4eQ66X19 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp4eQ66X19 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp4eQ66X19 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp4eQ66X19 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp4eQ66X19 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp4eQ66X19 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp4eQ66X19 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp4eQ66X19 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms