Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sdc3Q64519 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Sdc3Q64519 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Sdc3Q64519 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdc3Q64519 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Sdc3Q64519 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Sdc3Q64519 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdc3Q64519 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdc3Q64519 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdc3Q64519 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Sdc3Q64519 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdc3Q64519 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdc3Q64519 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdc3Q64519 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdc3Q64519 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdc3Q64519 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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