Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms