Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc18Q640L5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc18Q640L5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms