Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms