Protein–RNA interactions for Protein: Q62460

Gm20865, (clone BALB3N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20865Q62460 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20865Q62460 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms