Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Nptx1Q62443 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Nptx1Q62443 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Nptx1Q62443 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Nptx1Q62443 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nptx1Q62443 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nptx1Q62443 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nptx1Q62443 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nptx1Q62443 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nptx1Q62443 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nptx1Q62443 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nptx1Q62443 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nptx1Q62443 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nptx1Q62443 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nptx1Q62443 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nptx1Q62443 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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