Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

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Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtmQ62388 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
AtmQ62388 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
AtmQ62388 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AtmQ62388 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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AtmQ62388 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AtmQ62388 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
AtmQ62388 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtmQ62388 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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