Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SypQ62277 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SypQ62277 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SypQ62277 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SypQ62277 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SypQ62277 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SypQ62277 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SypQ62277 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SypQ62277 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SypQ62277 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SypQ62277 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SypQ62277 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SypQ62277 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SypQ62277 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SypQ62277 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SypQ62277 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SypQ62277 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SypQ62277 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SypQ62277 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SypQ62277 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SypQ62277 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SypQ62277 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SypQ62277 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SypQ62277 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SypQ62277 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SypQ62277 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SypQ62277 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SypQ62277 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SypQ62277 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SypQ62277 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SypQ62277 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SypQ62277 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SypQ62277 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SypQ62277 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SypQ62277 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SypQ62277 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SypQ62277 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SypQ62277 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SypQ62277 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SypQ62277 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SypQ62277 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SypQ62277 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SypQ62277 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SypQ62277 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SypQ62277 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SypQ62277 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SypQ62277 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SypQ62277 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SypQ62277 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SypQ62277 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SypQ62277 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SypQ62277 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SypQ62277 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SypQ62277 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SypQ62277 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SypQ62277 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SypQ62277 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SypQ62277 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SypQ62277 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SypQ62277 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SypQ62277 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SypQ62277 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SypQ62277 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SypQ62277 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SypQ62277 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SypQ62277 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SypQ62277 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SypQ62277 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SypQ62277 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SypQ62277 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SypQ62277 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SypQ62277 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SypQ62277 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SypQ62277 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SypQ62277 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SypQ62277 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SypQ62277 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SypQ62277 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SypQ62277 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SypQ62277 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SypQ62277 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SypQ62277 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SypQ62277 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SypQ62277 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SypQ62277 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SypQ62277 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SypQ62277 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SypQ62277 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SypQ62277 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SypQ62277 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SypQ62277 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SypQ62277 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SypQ62277 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SypQ62277 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SypQ62277 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SypQ62277 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SypQ62277 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SypQ62277 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SypQ62277 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SypQ62277 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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