Protein–RNA interactions for Protein: Q62192

Cd180, CD180 antigen, mousemouse

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Length 661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd180Q62192 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Cd180Q62192 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd180Q62192 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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