Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms