Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema3bQ62177 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sema3bQ62177 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sema3bQ62177 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sema3bQ62177 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sema3bQ62177 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sema3bQ62177 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sema3bQ62177 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sema3bQ62177 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sema3bQ62177 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sema3bQ62177 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sema3bQ62177 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sema3bQ62177 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sema3bQ62177 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sema3bQ62177 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sema3bQ62177 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms