Protein–RNA interactions for Protein: Q62074

Prkci, Protein kinase C iota type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkciQ62074 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkciQ62074 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms