Protein–RNA interactions for Protein: Q61481

Pde1a, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1A, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1aQ61481 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pde1aQ61481 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde1aQ61481 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde1aQ61481 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde1aQ61481 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pde1aQ61481 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pde1aQ61481 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde1aQ61481 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde1aQ61481 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde1aQ61481 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pde1aQ61481 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde1aQ61481 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde1aQ61481 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pde1aQ61481 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde1aQ61481 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde1aQ61481 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pde1aQ61481 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pde1aQ61481 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pde1aQ61481 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pde1aQ61481 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pde1aQ61481 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pde1aQ61481 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pde1aQ61481 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms