Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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