Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cln3Q61124 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms