Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JrkQ60976 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrkQ60976 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrkQ60976 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrkQ60976 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms