Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms