Protein–RNA interactions for Protein: Q60855

Ripk1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk1Q60855 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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