Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Klf4Q60793 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Klf4Q60793 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Klf4Q60793 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Klf4Q60793 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Klf4Q60793 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Klf4Q60793 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Klf4Q60793 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klf4Q60793 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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