Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms