Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms