Protein–RNA interactions for Protein: Q60611

Satb1, DNA-binding protein SATB1, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Satb1Q60611 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Satb1Q60611 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms