Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema5bQ60519 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sema5bQ60519 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sema5bQ60519 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sema5bQ60519 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sema5bQ60519 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sema5bQ60519 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sema5bQ60519 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sema5bQ60519 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Sema5bQ60519 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema5bQ60519 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema5bQ60519 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema5bQ60519 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema5bQ60519 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema5bQ60519 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema5bQ60519 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema5bQ60519 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema5bQ60519 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema5bQ60519 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema5bQ60519 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema5bQ60519 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema5bQ60519 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema5bQ60519 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema5bQ60519 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema5bQ60519 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema5bQ60519 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema5bQ60519 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema5bQ60519 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema5bQ60519 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema5bQ60519 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema5bQ60519 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema5bQ60519 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema5bQ60519 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema5bQ60519 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms