Protein–RNA interactions for Protein: Q5XFR0

Pabpn1l, Embryonic polyadenylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpn1lQ5XFR0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpn1lQ5XFR0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpn1lQ5XFR0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpn1lQ5XFR0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpn1lQ5XFR0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpn1lQ5XFR0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpn1lQ5XFR0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpn1lQ5XFR0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpn1lQ5XFR0 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpn1lQ5XFR0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpn1lQ5XFR0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpn1lQ5XFR0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpn1lQ5XFR0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpn1lQ5XFR0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpn1lQ5XFR0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpn1lQ5XFR0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpn1lQ5XFR0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpn1lQ5XFR0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpn1lQ5XFR0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpn1lQ5XFR0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpn1lQ5XFR0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpn1lQ5XFR0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpn1lQ5XFR0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpn1lQ5XFR0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpn1lQ5XFR0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpn1lQ5XFR0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpn1lQ5XFR0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpn1lQ5XFR0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpn1lQ5XFR0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpn1lQ5XFR0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpn1lQ5XFR0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpn1lQ5XFR0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpn1lQ5XFR0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpn1lQ5XFR0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpn1lQ5XFR0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpn1lQ5XFR0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpn1lQ5XFR0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpn1lQ5XFR0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pabpn1lQ5XFR0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pabpn1lQ5XFR0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pabpn1lQ5XFR0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pabpn1lQ5XFR0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pabpn1lQ5XFR0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pabpn1lQ5XFR0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Pabpn1lQ5XFR0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpn1lQ5XFR0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms