Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp13a3Q5XF89 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp13a3Q5XF89 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp13a3Q5XF89 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp13a3Q5XF89 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp13a3Q5XF89 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp13a3Q5XF89 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp13a3Q5XF89 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp13a3Q5XF89 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp13a3Q5XF89 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp13a3Q5XF89 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp13a3Q5XF89 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms