Protein–RNA interactions for Protein: Q5U406

Zfp78, Zinc finger protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp78Q5U406 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Zfp78Q5U406 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp78Q5U406 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp78Q5U406 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Zfp78Q5U406 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Zfp78Q5U406 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Zfp78Q5U406 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp78Q5U406 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Zfp78Q5U406 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp78Q5U406 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp78Q5U406 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp78Q5U406 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Zfp78Q5U406 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp78Q5U406 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp78Q5U406 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp78Q5U406 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp78Q5U406 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp78Q5U406 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp78Q5U406 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp78Q5U406 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Zfp78Q5U406 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp78Q5U406 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp78Q5U406 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp78Q5U406 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp78Q5U406 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp78Q5U406 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp78Q5U406 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Zfp78Q5U406 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp78Q5U406 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp78Q5U406 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Zfp78Q5U406 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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