Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rabl6Q5U3K5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rabl6Q5U3K5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rabl6Q5U3K5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rabl6Q5U3K5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rabl6Q5U3K5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rabl6Q5U3K5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rabl6Q5U3K5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rabl6Q5U3K5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rabl6Q5U3K5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rabl6Q5U3K5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rabl6Q5U3K5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rabl6Q5U3K5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rabl6Q5U3K5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rabl6Q5U3K5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rabl6Q5U3K5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rabl6Q5U3K5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rabl6Q5U3K5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rabl6Q5U3K5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rabl6Q5U3K5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rabl6Q5U3K5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rabl6Q5U3K5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rabl6Q5U3K5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rabl6Q5U3K5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rabl6Q5U3K5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rabl6Q5U3K5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rabl6Q5U3K5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rabl6Q5U3K5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rabl6Q5U3K5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rabl6Q5U3K5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rabl6Q5U3K5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rabl6Q5U3K5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rabl6Q5U3K5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rabl6Q5U3K5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rabl6Q5U3K5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rabl6Q5U3K5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rabl6Q5U3K5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rabl6Q5U3K5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rabl6Q5U3K5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rabl6Q5U3K5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rabl6Q5U3K5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rabl6Q5U3K5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rabl6Q5U3K5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rabl6Q5U3K5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rabl6Q5U3K5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rabl6Q5U3K5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms